大转基因玉米 [carlosdelcalle/iStock]
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独角兽造未来合成生物产业

Ginkgo生物工程和Zymergen往往因技术栈和商业方法而异

跨行业,如电子产品、药品、食品和材料, 工业合成生物开始生产我们更高效持续需要的商品使用合成生物方法-或对田间常识-创业公司和Fortune500公司都使用基因工程微生物制造从手机触屏到T恤棉到植物汉堡网

传统上,合成生物过程是一个缓慢和假设驱动的努力,依赖研究者天才 — — 和健康运算量 — — 设计这些微生物“微因子”。不再是了

两家公司都接受计算生物学的力量,从合成生物学中取出猜想并驱动这个年轻行业进入主流ymergen和Ginkgo生物作品都使用广博美术数据库、机器学习和强健自动化实验室设计微博定制适合制作理想产品两个组织都筹集了大量资本搭建平台,Zymergen在2018年筹集4亿SeriesC和Ginkgo生物作品在其生涯多轮中几乎翻倍

两位合成生物学先锋因各自的技术栈和商业模型而大相径庭分析两者之间关键差异可帮助理解合成生物产业整体演化方式和值前台隐藏合成生物生态区

合成生物价值链

工业合成生物核心提供一条路径,既生产人类典型各种材料-如塑料、纺织品、食品和药品-效率更高,又制造全新物质生产生物产品依赖三步过程

1) 分子识别:识别拟创建的分子;

2) 生物设计:设计微生物制造良品并

3) 终端制造:扩展制造

重叠简化三步价值链对每个组织核心能力说明两公司希望在哪里在工业合成生物领域竞争,以及它们如何可能与空间中其他角色并存(或非并存)。

共享强点:生物设计

zymergen和Ginkgo都围绕生物设计过程建立了广泛的竞争语句搭建大规模并不断增长的算法数据库-映射基因、蛋白质和代谢路径-并投放资本到能操作高通量实验的自动化实验室-两家公司已实现起飞速度水平,使其免入未来挑战者想入场

两家公司都接受研发进程,创建积极的反馈循环机制,自始至终提高设计微生物的能力并加大与任何潜在竞争者之间的距离两家公司利用大规模数据集培训机器学习算法,帮助设计面向特定目的的潜在微生物并转向自动化实验室测试数千株性能,创建新数据点以进一步改进下批微生物机学习

两家公司生物设计栈在数据集大小、软件强健性以及硬件自动化方面存在重要差异,但两者都可称精通合成生物价值链生物设计部分

整合合成生物价值链其余部分

除生物设计外,Ginkgo和Zymergen对分子识别和终端产品制造都采取了不同方法ymergen开发化学和材料数据集并支持实验室基础设施严格扫描数据库以寻找有前途的分子,预测适合特定目的并实证测试预测微信Zymergen宣布三种产品-电子生物膜、昆虫驱虫剂和作物虫害控制剂-据报导这些都是完全新奇的、从未使用过分子

ymergen还努力内化端产品制造能力后Zymergen设计产品后,转由近距离生物制造伙伴网络为下游客户和伙伴生产终端产品“内部”。

Ginkgo几乎完全专注于生物设计块-也许有很好的理由预测新分子行为能力因应用而异并需要多套工具:分析电子消耗品所用分子与分析食物或营养所用分子大相径庭,稀释模子识别技巧可扩缩性正因如此,Ginkgo平台较少关注全新物质发现,而更多关注寻找更好的制造方法

关于终端产品制造,商业生物制造代表一种相当老化技术-它主要依赖制造啤酒所用的发酵过程

Ginkgo认为合成生物过程端产品制造元素相对通化,他们的平台不提供边际优势Ginkgo世界观中,Molecule识别似乎太专业超出核心能力范围,而终端产品制造可能太通化无法提供更多附加值

归根结底,Zymergen定位为拥有基础设施覆盖全产品开发过程的“产品”公司,Ginkgo则起“平台化”作用,为合成生物价值链中有价值的链路提供模块化解决方案ymergen可生产别处都找不到的有色产品-Zymergen可为此唯一值收费

Ginkgo缺少内部产品引擎,投下与产业革新家和内部分流网广网,实际上创建了一个分散化产品发现网络,利用生物设计平台将产品推向市场

预测未来合成生物生态

这两家公司早期策略可能无法显示未来演化,但它们当前方向的确反映了它们在大型合成生物生态圈中预期作用。一方面,Zymergen似乎正在驱动世界,在这个世界中,他们可以作为面向任何人制造或材料需要的一站式商店-他们可以识别最佳物质,工程最优生物生产并制造产品销售客户

Ginkgo平台允许分布性更强的生态环境-在那里他们可以利用生物设计方面的独特知识向下游伙伴提供实施自身生物制造过程的关键密钥

如果这两种方法都能够成功将合成生物带入主流,我们都可以从更清洁、更健康、更丰富世界中受益。

Matthew Kirshner在Putnam Associates生命科学咨询公司工作,重点是药理学和生物技术组织将新药理学诊断学商业化与本文章引用的两家公司的工作无关

原创遗传工程和生物技术新闻https://www.genengnews.com/gen-edge/a-unicorn-rivalry-shaping-the-future-of-the-synbio-industry/

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马修基什纳

Matthew Kirshner长期热心新兴生物技术公司Putnam Associates生命科学咨询公司,侧重于将药用和生物技术产品推向市场Matt写新应用合成生物技术, 变化合成生物景观, 以及领先合成生物公司决策背后的商业策略并可在matthew.kirshner@gmail.com访问

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