照片信用iGEM马尔堡团队文章带给你
Embriet Hyde今年iGEM巨型Jamboree结业科学童话故事 盛大大大大赛优胜队 高校分队团队马尔堡由15名硕士生组成的团队研究传统生物、分子和细胞生物、化学、物理和计算机科学原创思想生于2017年大会上-并大都由实验室自动化导师OT2管道机器人实现开关器以大奖和新生物工具结束,这些工具可改变合成生物学家创建新代谢路径、遗传电路和其他脱氧核糖核酸构造的方式
取胜项目VibriGens基于新细菌底盘机体维布里欧核子世界上生长最快的细菌 倍增时间只有10分钟或更少E.西里岛半个小时翻番)团队努力建立克隆协议、蛋白表达式和蛋白交互研究V级纳特里根斯并搭建一套系统优化应用-任何研究者都可向团队发邮件请求-
并创建了“马尔堡集合库”,一个金门克隆工具盒,使研究者能够组合复制、抗生素抗药性及目标基因等各种粒子源-消除依赖矢量的需要克隆工具盒初始创建V级纳特里根斯团队最终设计它 普遍适用数个不同的宿主机体和优化菌株相似 马尔堡集合 也将提供给研究者
很久以前... 思想诞生
选择V级纳特里根斯并非偶然团队在2017年德国合成生物协会在马尔堡召开的一次会议上首次听到这种生物发言者之一讲演V级纳特里根斯当团队不仅知道它生长多快, 而且也知道没有人真正使用生物时, 他们开始想用它帮助合成生物圈
iGEM竞赛从未使用过它, 所以我们可以实现新事物-它能真正帮助很多人因为在所有合成生物领域 需要生物构建团队成员Daniel Marchal解释道:
因为它住在盐水V级纳特里根斯高盐度可容E.哥里使它更适用于某些环境应用中需要更高含盐量(例如优化海洋塑料的细菌退化)因为大多数生物无法容忍高盐度协议使用V级纳特里根斯团队成员Rene Inckemann表示-当高纯度脱氧核糖核酸或蛋白为最终目标时关键
提高从产品设计到市场速度的潜力也是团队所强调之事Inckemann喜欢使用抗疟药反敏素实例开发amycin像7年试想一下,如果你使用维布里欧加速进程开发时间他也看到维布里欧作为一种实用工具 合成生物学家研究蛋白进化 工程蛋白和酶 或设计遗传电路基本地说,开发各种部件的速度可以通过使用世界增长最快机体提高-这对合成生物是件好事。
更多研究集团、公司和其他组织努力加速合成生物研究的各个方面合成生物栈分层整合生物试剂、过程执行工具以及生物CAD/CAM工具以促进快速产品设计开发团队马尔堡在合成生物栈生物层创建新工具后,正顺利实现使科学对全世界合成生物学家更快易达的目标。自动化在帮助他们实现该目标方面发挥着关键作用。
通过自动化实现项目
一天或12小时内想克隆时-即我们所提议时-许多人会说这太难实现日间工作流并得到了响应相当早项目中, Inckemann说。团队向数家实验室自动化公司提交提案,为项目获取自动化支持一公司为Opentowers
Opentowers科学开发主管Kristin Ellis表示:「二周内共收到77项推荐书,选择Marburg团队是非脑力
Ellis说 :"我被他们的推荐打飞了"特别令她被迫将细菌变换时间从数天减到12小时-与许多其他人怀疑的相同景象Ellis还赞赏Tech Marburg的建议iGEM插件学习并计划分享V级纳特里根斯并与其他iGEM团队协议学习细菌在其他实验室的行为方式Opentrons一个特别重要的组成部分,它强调并支持开源、协作和可复制科学
OT2甚至尚未发布时建议到期(3月发布6月发布)、Teet Marburg九组iGEM接收OT2是世界第一批人使用机器人-
Inckemann表示:「我们中没有人有实验室自动化实战经验-我们中有些人有几门大学课程,发现很容易使用OT-2程序关键地说,拥有OT-2允许团队花时间设计并构思项目,而机器人则为他们运行实验,省下数月人工时间并允许团队在夏季完成项目
团队甚至有时间在OT-2软件上搭建自己的工具-Opentrons鼓励所有用户都这样做团队Marburg搭建易用接口,用户从Marburg工具箱中的8个组件或工具中选择机器人一旦选择后知道如何处理每个组件, 建立用户自定义图集而无进一步输入
故事充满欢乐结束
Ellis说道,“他们不单提出惊人项目,而且实际实现”。iGEM团队实验、协作分享强源自动化, 但我们并不想规范我们选择团队使用OT-2-我们完全被吹散,没有人能编造这个故事球队太有启发性
马尔堡团队并非唯一拥有巨人Jamboree的OT2团队团队大都为工作获奖牌(7枚为金子! )和团队NCKU台南获本科最佳环境项目和最佳演示奖数组OT-2获奖队为最佳能源项目、最佳招贴画、最佳创业项目和最佳计量等类特殊赛道奖决赛每一队都做了杰出工作身处能支持所有这些学生和他们的项目之地 棒极了 Ellis补充
Opentrons和iGEM共享值真正使故事成真,回想起来,我们在iGEM 2014上首次启动OT-One,四年后 球队开始使用OT2做这些令人难以置信的项目 并获大奖真正满足的是能还给他们。”
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