maxx chatsko.Real-time PCR has become an increasingly useful and popular tool in the lab, but with machines costing tens of thousands of dollars, it’s use has been out of reach to those without big budgets or the ability to leverage a well-equipped wet-lab. If you’re a biohacker you can basically kiss the thought of using real-time PCR, or qPCR, goodbye. Right? Well, not for long. SynBioBeta recently interviewed Josh Perfetto of Chai Biotechnologies to learn more about the Open qPCR (@openqpcr）Kickstarter项目。
柴氏生物科技是什么?
柴成立于2013年底，使分子和合成生物学的基本工具更易进入 - 意思不仅便宜，而且更好地设计，更容易使用，更开放。
Open qPCR从何而来?
在创建早期的OpenPCR之后，我正在研究合成生物学项目，并且需要量化基因表达。所以我在拍卖时拿起了一个笨重的10岁的实时热循环员。这是可怕的 - 我在实际上花了几天，试图让并行港口与现代计算机一起使用。
但是，接下来发生了什么意识到我 - 我爱上了机器及其能力，而不仅仅是为了量化，而且为整个各种各样的优势。现在我有机器，我几乎用它几乎每次PCR反应都跑了。我意识到这么多同事们没有意识到这些优势主要是因为他们从来没有访问过这样的机器 - 除非你真的需要他们的量化能力，否则它们太贵了。因此，开放QPCR的想法出生。
谁可以使用开放QPCR？
它非常广泛地定位：当然，任何实验室都没有获得实时热循环器，也是高中教室和Diybio群体和社区实验室。
什么是实时PCR，它的用途是什么?
实时PCR，也常被称为qPCR，是一种监控整个PCR反应中扩增DNA数量的系统，因此是“实时”的。最明显的应用是对原始模板的量化，这有助于测量基因表达。
但还有更多的用途。例如，我们都知道PCR引物可能会错引，所以简单的引物对往往不能做出很好的诊断。但通过加入第三种被称为探针的寡聚物，这种检测可以变得更具体，几乎对错误引物免疫。
但我最喜欢的用途是最平凡的。实时聚合酶链反应为您提供关于您运行的每个反应的结果和质量的即时反馈，包括是否存在非特异性产品。如果出了什么问题，你马上就能知道，不需要使用凝胶。这是一件小事，但当你在设计一个生物系统时，有很多小事情可能会出错。在每一步都有更智能的工具，使我们能够专注于更大的图景。
Open qPCR和Open PCR的区别是什么?
除了我和这两个项目的个人经历之外，真的没有任何联系。OpenPCR是一种终末PCR热循环仪，作为自己组装的工具出售。Open qPCR是一种实时热循环仪，作为专业制造的产品销售。Open qPCR也有更好的性能和软件。
Open qPCR的规格是什么?
它有16个200 uL的反应孔，5 C/s的温度斜坡，绿色荧光体的实时检测，现代的web界面，触摸屏，以太网，wifi和USB接口。
除了开源硬件的开放式QPCR之外，系统还配有开源软件，用于每次运行可视化。新软件程序可能有可能吗？
该软件支持放大曲线，存在/缺席检测，熔化曲线，我们目前正在实施相对量化。它也有一个非常现代，精心设计的网络界面，包括一个视觉协议和板块编辑器，这使机器非常容易使用。
典型的qPCR仪器的价格在2万美元以上。是什么让Open PCR以很小的成本提供Open qPCR ?
我们利用了诸如Beaglebone黑色控制器板等开源软件和硬件，并且还将机器限制为16井块和单荧光团检测。这些肯定将是一些不可接受的局限性，但它使该设备能够负担于不需要更多高级系统的众多用户。
Open qPCR可以使用哪些试剂?
您可以使用任何染料/探针，与FAM等绿色荧光团。我们还将释放我们自己的IP无嵌入染料，称为柴绿。
对所有人来说都是好消息
该项目很快就实现了5万美元的融资目标，并已攀升至13.4万美元以上，这意味着在Kickstarter项目结束后，Open qPCR将对所有人开放。虽然资金目标已经实现，但今天你仍然可以通过访问项目页面。
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